電影《史前超人》講述的是公元一萬五千年前高度文明的亞特蘭蒂斯大陸被一場大海嘯掀入海底隨後新的生命和文明再次在地球誕生明朝末年鄭成功的副將唐文瀾在大海中拾獲裝有亞特蘭蒂斯王子的命運女神之匣並將嬰兒收養為義子取名唐律唐律生來便具有亞特蘭蒂斯人的超能力神的血脈讓他的外貌始終維持在26歲的模樣為了尋找聖石的下落唐律從歐洲回到2018年的中國與身世神秘的屌絲女記者朱安安相識朱安安無意中觸發了引動聖石的媒介令她也擁有了某些常人不具的異能兩人鬧出各種匪夷所思的笑話與此同時國外某神秘機構的生化科學家、擁有黑暗力量的小矮人月見璃博士一直覬覦聖石並不惜一切代價找尋與亞特蘭蒂斯有關的事物正邪大戰一觸即發……